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武汉空间转录组测序服务公司

发布时间:2022-08-09   来源:优博企业信息网   阅览次数:799次   

烈冰科技作为国内同时拥有10XGenomics和BDRhapsody双分选平台的测序服务商及云计算服务供应商,经过多年实战,拥有丰富的单细胞悬液制备和分选经验,实测BDRhapsody对能够高效捕获粒细胞。针对不同的分选平台、建库方法,实战总结搭建出不同的数据预处理工作流程;烈冰科技NovelBrain®生物大数据平台能有效支撑生命科学研究、医疗健康等领域对大数据分析的需求。完备的高通量测序实验平台,包括NovaSeq6000、10XChromiumX、BDFACSMelody、PANNORAMIC数字切片扫描仪等,配合一支来自海内外名校、多学科交叉型的高素质综合团队,为您的科学研究保驾护航。ATCG碱基的排列组合构成了测序的庞大世界。武汉空间转录组测序服务公司

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空间转录组数据可以用单细胞转录组数据的分析策略进行分析,例如,利用GO和Pathway分析筛选不同发育时期特定空间区域内的信号通路及其关键基因的较大情况,揭示在特定发育时期特定区域内发生的生物学过程。针对任何一个基因,空间转录组可以显示表达该基因的点阵及其空间排布;单细胞转录组可以给出该基因表达的细胞类群;原位测序可以给出该基因在细胞内的表达状况。通过不同发育时间点的信息比较,可以分析细胞类群在某个部位在不同时间点的差异,给出其在细胞内的真实的演变状况。杭州烈冰科技空间转录组数据分析可视化全线搭建10x Genomics空间转录组测序平台。

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单细胞测序技术是一种在单细胞水平上对基因组、转录组、表观组等进行高通量测序分析的技术。单细胞测序技术能够在组学水平揭示细胞间的异质性。单细胞水平细胞谱系追踪技术位居2018年Science 杂志评选的科学突破。常规单细胞转录组测序技术丢失了细胞在原组织中至关重要的空间位置信息,而单细胞空间转录组技术在进行单细胞转录组测序的同时保留并记录了细胞的空间位置信息。空间转录组技术能够揭示细胞间的相互作用以及细胞所处的微环境,将成为发育生物学、神经生物学、免疫生物学等领域的研究利器。

空间转录组测序的数据质量和玻片有效区域的利用率、贴片的质量和透化时间息息相关。贴片质量不良会影响总的有效spot数等;而透化不合理会导致spot的reads数、基因中位数等参数。而在特异性基因表达方面,我们也可以统计空间转录组群体的特异性基因表达即Markergene,将他们在组织切片以及空转上进行着色。我们也可以对于任意一个已知的基因或者数据库中的一些细胞Marker,然后将其在基因表达在空间转录组的切片以及HE染色上展示自己的基因表达进而了解,群体中的可能的细胞组成关系。助力探索生命时空多维度的动态变化的生物学信息;助力生命健康医疗大时代!

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空间转录组测序的数据分析基本分为三个阶段:1.数据的预处理部分;2.Spot点阵的分群与定义;3.Spot分群的功能与生物学价值。每一个部分都不可或缺,其结果都对后续的分析结果有重要影响。由于空间转录组的序列结构与单细胞转录组测序的左端序列结构是非常接近的,都是Cellbarcode/SpotBarcode+UMI+捕获区域这样的设计。右端普遍为捕获的RNA序列。因此采用单细胞的原始数据过滤策略即可,左端可以考虑切下捕获区域前的序列区域作为后续分析用的序列以减少分析负荷。随后,采用10X官方的Spatialranger的策略进行后续分析,解析出位于空间位置中的有效的Spot表达矩阵。烈冰专精空间转录组测序领域。济南BD空间转录组测序

强势发文!烈冰空间转录组测序助力揭示愈伤组织能再生的机制。武汉空间转录组测序服务公司

烈冰生信团队倾情研发的NovelBrain®生信大数据分析平台,针对庞大的单细胞测序数据,能够实现细胞类型鉴定的快、精、准:一键导入genelist构建个性化基因列表;轻松一点即可展示Marker基因的Featureplot;任意修改Cluster的颜色和名称助力高效鉴定细胞类型;一键获得t-SNE图、Heatmap和Violin图:轻松获得并下载基因表达的t-SNE图、Heatmap、Violin图,还可以通过调节宽、高和系数比例来调节美观。平台上线300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板,帮助烈冰生信分析团队和自主分析用户实现分析工具和模板的快速调用和一站式全流程自动化分析,节省您的工作时间并提升整体工作效率。武汉空间转录组测序服务公司

上海烈冰生物医药科技有限公司发展规模团队不断壮大,现有一支专业技术团队,各种专业设备齐全。致力于创造的产品与服务,以诚信、敬业、进取为宗旨,以建NovelBio,烈冰生物,NovelBrain,PanoCell,烈冰智造产品为目标,努力打造成为同行业中具有影响力的企业。我公司拥有强大的技术实力,多年来一直专注于生物科技、医药科技、信息科技、计算机科技领域内的技术开发、技术服务、技术转让、技术咨询,市场营销策划,市场信息咨询与调查(不得从事社会调查、社会调研、民意调查、民意测验),从事货物及技术的进出口业务,计算机、软件及耗材(除专控),软件开发【依法须经批准的项目,经相关部门批准后方可开展经营活动】的发展和创新,打造高指标产品和服务。诚实、守信是对企业的经营要求,也是我们做人的基本准则。公司致力于打造的单细胞测序,生物大数据云分析平台,空间转录组测序,单细胞多组学测序。

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