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江苏蛋白组代谢组学整合分析

发布时间:2022-08-08   来源:优博企业信息网   阅览次数:973次   

GC-MS非靶向代谢组学等研究方法:2021年10月,广东石油化工大学环境科学与工程学院孙建腾教授课题组在《Chemosphere》期刊发表的题为“metabolomic analysis and oxidative stress response reveals the toxicity in Escherichia coli induced by organophosphate flame retardants tris (2-chloroethyl) phosphate and triphenyl phosphate”的研究成果,通过GC-MS非靶向代谢组学等研究方法,发现包括糖酵解/糖异生、磷酸戊糖代谢、嘌呤代谢、谷胱甘肽代谢、胺素代谢,丙氨酸和天冬氨酸等代谢途径被破坏。大多数差异表达的代谢物被下调,表明有机磷阻燃剂对代谢功能和关键代谢途径有抑制作用。本研究揭示了生物中有机磷阻燃剂对环境产生的风险提供了新的见解。代谢组学-欧易生物/鹿明生物 客户好评 专注代谢组学研究。江苏蛋白组代谢组学整合分析

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高通量代谢组学研究,中文标题:高通量代谢组学方法发现羊藿提取物对骨质疏松症影响的代谢生物标志物及途径发表期刊:Frontiersinpharmacology影响因子:5.810发表时间:2020年8月发表单位:南昌大学附属医院运用组学技术:超高效液相色谱法结合四极杆飞行时间质谱法技术(UPLC-Q-TOF/MS)代谢组学。本研究采用UPLC-Q-TOF/MS代谢组学对OP模型中的大鼠和不同剂量Ext-epi处理的大鼠进行分析,从大鼠血清代谢组学和标志物相关代谢途径中揭示了46种潜在生物。不同剂量组的Ext-epi对16种潜在的生物标志物具有的逆转作用,涉及三种主要的代谢途径,其中ZL-IL的效果相对稳定,组间聚类比较明显,该剂量可被视为进一步研究的更好剂量。本研究从代谢组学水平评估了Ext-epi对OP的预防和效果,为开发Ext-epiOP提供了依据,也为开发OP提取物提供了参考。浙江代谢组学定性定量代谢组学——研究对象大都是相对分子质量1000以内的小分子物质。

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本研究通过LC-MS和GC-MS双平台代谢组学研究方法,对92例样品5个时间点的尿液样品进行分析,分别找到了33种和155种与PM和生物气溶胶相关的差异标志物,结果揭示了年轻健康人在五个不同时间点的尿液代谢谱的动态变化,采用KEGG通路富集分析和时间序列分析确定了与短期共同暴露于空气中PM和生物气溶胶相关的几种潜在代谢物生物标志物,发现短期高浓度暴露于PM可能会导致代谢改变并降低应激水平,这可能是与下丘脑-垂体-肾上腺和交感-肾上腺-髓质轴的有关;而生物气溶胶剂则通过系统对病理性成瘾有重要作用。其中尿液中的16-脱氢孕酮可能是PM暴露的潜在生物标志物;4-羟基苯乙醇可能是生物气溶胶的潜在生物标志物,可用于分别预测或诊断PM或生物气溶胶相关疾病。

GC-MS非靶向代谢组学yan'j2021年11月,上海交通大学医学院附属新华医院冯丽萍教授课题组在Science of the Total Environment期刊发表了题为“Transcriptomics integrated with metabolomics reveals the effect of Bisphenol F (BPF) exposure on intestinal inflflammation ”的研究成果,通过GC-MS非靶向代谢组学和转录组学研究方法,发现了BPF暴露的肠道毒性的特征,探究了可能的发病机理。

中文标题:转录组学结合代谢组学揭示了双酚F(BPF)暴露对肠道炎症的影响研究对象:人结肠粘膜上皮细胞系(NCM460)发表期刊:ScienceoftheTotalEnvironment影响因子:7.963发表时间:2021年11月合作单位:上海交通大学附属新华医院运用生物技术:GC-MS非靶向代谢组学(由鹿明生物提供技术支持)、转录组学、qRT-PCR 欧易生物助力靶向/非靶向代谢组学研究。

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非靶向GC-MS代谢组学、LC-MS代谢组学研究标题:中国浓香白酒生产过程中人工窖泥中原核生物群落的结构和功能变化研究对象:浓香白酒、人工窖泥期刊:mSystems影响因子:6.469发表时间:2020年3月合作单位:四川省农业科学院水稻高粱研究所运用欧易/鹿明生物技术:TMT标记定量蛋白质组学、PRM靶向验证、非靶向GC-MS代谢组学、LC-MS代谢组学、16SrRNA测序,本篇非靶向代谢组学分析共鉴定出7,478种代谢物。GC-MS代谢组学和LC-MS代谢组学方法在OPA中均可明确分离批次(图5a至d)。在第四批人工窖泥样品中,分别上调和下调了491和523种代谢物。差异代谢产物被分为16个功能类别(图5f)。脂质和类脂质分子(38.07%)**多,其次是有机杂环化合物(16.17%)和有机酸及其衍生物(13.11%)。代谢组学交流—代谢组贴吧—代谢组学咨询。江苏粪便代谢组学检测

代谢组学——后基因组时代新热点。江苏蛋白组代谢组学整合分析

通过转录组学和代谢组学(GC-MS非靶向代谢组学)对BPF暴露和对照组的细胞进行分析,筛选到差异的基因和代谢物。分别通过富集分析,找到差异基因或代谢物参与的条目或通路。通过差异转录本、代谢物和促炎细胞因子的综合分析,揭露了它们之间的关系。本文通过多组学分析和体外模型的方式,发现了BPF暴露后肠上皮细胞转录组和代谢组谱的改变,揭露了BPF可能在肠道炎症发病机制的作用。中文标题:转录组学结合代谢组学揭示了双酚F(BPF)暴露对肠道炎症的影响研究对象:人结肠粘膜上皮细胞系(NCM460)发表期刊:ScienceoftheTotalEnvironment影响因子:7.963发表时间:2021年11月合作单位:上海交通大学附属新华医院运用生物技术:GC-MS非靶向代谢组学(由鹿明生物提供技术支持)、转录组学、qRT-PCR江苏蛋白组代谢组学整合分析

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